دعاؤه بعد تهدیه لقبول ولایة العهد
اللهم انک قد نهیتنی عن الالقاء بیدی الی التهلکة، و قد اشرفت من قبل عبدالله المأمون علی القتل متی لا اقبل ولایة عهده، و قد اکرهت و اضطررت کما اضطر یوسف و دانیال، اذ قبل کل واحد منهما الولایة من طاغیة زمانه، اللهم لا عهد الا عهدک، و لا ولایة الا
من قبلک، فوفقنی لاقامة دینک، و احیاء سنة نبیک
فانک انت المولی و النصیر، و نعم المولی انت، و نعم النصیر.
دعاء آخر
باسناده عن یاسر قال: لما ولی الرضا علیهالسلام العهد سمعته – و قد رفع یدیه الی السماء – و قال: اللهم انک تعلم انی مکره مضطر، فلا تؤاخذنی، کما لم تؤاخذ عبدک و نبیک یوسف حین وقع الی ولایة مصر.
دعاؤه بعد تهنئته بولایة العهد
بسم الله الرحمن الرحیم
الحمدلله الفعال لمحا یشاء، لا معقب لحکمه، و لا راد لقضائه یعلم خائنة الاعین و ما تخفی الصدور، و صلی الله علی محمد فی الاولین و الاخرین و علی اله الطیبین الطاهرین.
دعاؤه بعد رجوعه من الجامع یوم الجمعة لطلب موته
اللهم ان کان فرجی مما انا فیه بالموت، فعجله لی الساعة.